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利用转录组测序分析与华重楼种子休眠解除相关差异基因 总被引:1,自引:0,他引:1
为探究华重楼种子休眠解除过程中差异基因的表达情况及相关代谢通路,以华重楼休眠解除前后种胚为材料,利用新一代高通量测序手段对供试样品进行转录组测序并进行系统生物信息学分析。从cDNA文库中分别获得62 882 650,62 263 366个clean reads,共得到69 248个差异表达基因,上调的表达基因有56 426个,下调的表达基因有12 822个。共有138 267个差异表达基因被GO功能注释到生物进程、分子功能和细胞组分3个大类58个亚类,注释的差异表达基因与代谢过程、生物调控、细胞组分合成和酶催化活性等密切相关。对58 722个差异表达基因进行pathway显著性富集分析,共发现139个代谢通路,休眠前后的DEGs主要富集在碳代谢、次生代谢产物生物合成和多糖代谢等途径。基于KEGG数据库中注释结果,共发现16条与华重楼休眠解除相关的代谢通路。华重楼种子发育与休眠解除过程中大量与种胚形态建成、多糖分解及蛋白质合成的差异基因参与表达,涉及到多个代谢途径的相互作用,构成复杂的休眠解除调控网络。 相似文献
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A. Nunes R. Ardau A. Berghöfer A. Bocchetta C. Chillotti V. Deiana J. Garnham E. Grof T. Hajek M. Manchia B. Müller-Oerlinghausen M. Pinna C. Pisanu C. O’Donovan G. Severino C. Slaney A. Suwalska P. Zvolsky P. Cervantes M. del Zompo P. Grof J. Rybakowski L. Tondo T. Trappenberg M. Alda 《Acta psychiatrica Scandinavica》2020,141(2):131-141
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目的:观察调神针刺法治疗不安腿综合征及其伴发睡眠障碍、焦虑情绪的临床疗效,为调神法在临床上的应用提供理论依据。方法:将60例患者随机分为观察组和对照组,每组30例。对照组予常规针刺治疗,穴取足三里、阳陵泉、悬钟等下肢局部腧穴;观察组在对照组取穴基础上加用百会、神庭、本神。两组均每日治疗1次,每周6d,1周为一疗程,连续治疗3个疗程。观察两组患者治疗前后国际不安腿综合征评定量表(IRLS)、匹兹堡睡眠质量指数(PSQI)和汉密尔顿焦虑量表(HAMA)评分变化。结果:治疗后两组患者IRLS评分、PSQI和HAMA总评分均较治疗前下降(P<0.05),且观察组治疗后各评分改善均优于对照组(P<0.05)。结论:在常规针刺基础上,调神针刺法可明显减轻不安腿综合征患者的下肢不适感,改善其睡眠障碍和焦虑情绪,疗效优于单纯常规针刺。 相似文献